改建后的玉器館對原有體系和展品內容進行了適度調整，分為“神秘奇幻的史前玉器”、“端莊典雅的夏商西周玉器”、“靈動不拘的春秋戰國玉器”、“雄健瑰麗的漢晉玉器”、“清新多元的唐宋遼金玉器”、“炫巧爭艷的元明清玉器”六個部分，展品近三百件。此外，此次開館新展出了近年入藏的西周晚期的幎目綴玉，其為當時上層貴族死后用來覆面的高級葬玉，是兩漢盛行的玉衣的濫觴，對研究葬玉制度的演變和發展具有重要意義。

    此外，這次玉器館還對一些重要展品特別設置了由日本制造的先進的避震裝備。當遇及強烈地震時，避震裝備能有效防止文物傾翻或跌落。此避震設施為國內博物館行業內的首次運用。